用于體外擴(kuò)增特定的PCR擴(kuò)增儀
【簡(jiǎn)單介紹】
PCR技術(shù)主要過(guò)程是,通過(guò)人類(lèi)合成的一小斷單鏈DN段(叫做引物)與模板DNA特定的區(qū)域特異性結(jié)合,進(jìn)而以四種dNTP為底物,通過(guò)DNA聚合酶沿著引物和模板形成的雙鏈部分的3’端聚合形成DN段實(shí)現(xiàn)DNA體外擴(kuò)增的過(guò)程。
【詳細(xì)說(shuō)明】
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase chain reaction,PCR)是一種分子生物學(xué)技術(shù),用于體外擴(kuò)增特定的DN段。
PCR技術(shù)主要過(guò)程是,通過(guò)人類(lèi)合成的一小斷單鏈DN段(叫做引物)與模板DNA特定的區(qū)域特異性結(jié)合,進(jìn)而以四種dNTP為底物,通過(guò)DNA聚合酶沿著引物和模板形成的雙鏈部分的3’端聚合形成DN段實(shí)現(xiàn)DNA體外擴(kuò)增的過(guò)程。其中,zui重要的是熱穩(wěn)定的DNA聚合酶,由于該酶在97度以上的高溫也能保持穩(wěn)定,所以我 們可以通過(guò)94~97度這個(gè)溫度范圍內(nèi)處理DNA形成單鏈,然后降溫(根據(jù)引物不同而有差異,一般為50-55度)直至適量的引物結(jié)合到模板上。zui后溫度提升至72度,聚合酶聚合形成雙鏈DNA。
經(jīng)典方法
PCR體系組分
DNA模板(template),含有需要擴(kuò)增的DN斷。
2個(gè)引物(primer),決定了需要擴(kuò)增的起始和終止位置。
DNA聚合酶(polymerase),復(fù)制需要擴(kuò)增的區(qū)域。
脫氧核苷三磷酸(dNTP),是指4種脫氧核糖核酸,用于構(gòu)造新的互補(bǔ)鏈。
緩沖體系,提供適合聚合酶行使功能的化學(xué)環(huán)境。
H2O 為了保持各個(gè)組分的濃度,在體系中加水稀釋
注意:部分品牌緩沖液不含有Mg2+,那么還需要添加對(duì)應(yīng)濃度的Mg2+。酶請(qǐng)zui后加入,水請(qǐng)zui先加入。
PCR步驟
1. DNA變性
(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下, 氫鍵斷裂,形成單鏈DNA。
2. 退火
(25℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。
3. 延伸
(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性*)的作用下,以dNTP為原料,從引物的5′端→3′端延伸,合成與模板互補(bǔ)的DNA鏈。
PCR的循環(huán)參數(shù)
1. 預(yù)變性(Initial denaturation)
模板DNA*變性與PCR酶的*激活對(duì)PCR能否成功至關(guān)重要,建議加熱時(shí)間參考試劑說(shuō)明書(shū),一般未修飾的Taq酶激活時(shí)間為兩分鐘。
2. 循環(huán)中的變性步驟
循環(huán)中一般95℃,30秒足以使各種靶DNA序列*變性,可能的情況下可 縮短該步驟時(shí)間,變性時(shí)間過(guò)長(zhǎng)損害酶活性,過(guò)短靶序列變性不*,易造成擴(kuò)增失敗。
3. 引物退火(Primer annealing)
退火溫度需要從多方面去決定,一般根據(jù)引物的Tm值為參考,根據(jù)擴(kuò)增的長(zhǎng)度適當(dāng)下調(diào)作為退火溫度。然后在此次實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)上做出預(yù)估。
退火溫度對(duì)PCR的特異性有較大影響。
4. 引物延伸
引物延伸一般在72℃進(jìn)行(Taq酶zui適溫度)。但在擴(kuò)增長(zhǎng)度較短且退火溫度較高時(shí),本步驟可省略 延伸時(shí)間隨擴(kuò)增片段長(zhǎng)短而定,一般*在1000 bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生設(shè)定為1 min/kbp。
5. 循環(huán)數(shù)
大多數(shù)PCR含25-40循環(huán),過(guò)多易產(chǎn)生非特異擴(kuò)增。
6. zui后延伸
在zui后一個(gè)循環(huán)后,反應(yīng)在72℃維持5-15分鐘.使引物延伸*,并使單鏈產(chǎn)物退火成雙鏈。
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